Muzikologų sekcija - juridinio statuso neturintis Lietuvos kompozitorių sąjungos padalinys, jungiantis LKS narius - muzikologus, muzikos kritikus, etnomuzikologus. Tai svarbiausia nacionalinė muzikologų organizacija, telkianti ir koordinuojanti bendruomenės narių iniciatyvas tyrinėjant ir populiarinant Lietuvos muzikos kultūrą, plėtojant nacionalinę muzikologijos tradiciją, rūpinantis tarptautine šalies muzikos ir muzikologijos sklaida.

Muzikologų sekcija inicijuoja ir koordinuoja nacionalines ir tarptautines Lietuvos muzikos kultūros tyrinėjimų, sklaidos, populiarinimo programas. Tradicinės sekcijos veiklos formos - konferencijų ir seminarų organizavimas, leidyba, edukacinė veikla. Sekcija remia ir skatina narių profesinę raišką, organizuoja geriausių muzikologijos darbų konkursus.

Muzikologų sekcija kaip LKS padalinys atstovauja muzikologų bendruomenę Lietuvoje ir užsienyje, plėtoja tarptautinius ryšius su analogiškomis muzikologų bendruomenėmis ir organizacijomis, puoselėja tęstinius ir inicijuoja naujus projektus. LKS muzikologų sekcija dalyvauja Tarptautinės muzikologų draugijos (IMS/International Musicological Society) veikloje.

Muzikologų sekcija veikia pagal reglamentą. Sekcijos veiklą koordinuoja pirmininkas (ir vicepirmininkas) bei septynių asmenų muzikologų sekcijos biuras.

LKS muzikologų sekcijos biuras:
(nuo 2009 m. gruodžio 14 d.)
Beata Baublinskienė (vicepirmininkė)
Gražina Daunoravičienė
Jūratė Katinaitė (pirmininkė nuo 2010 m. birželio 22 d.) jkatin@lrt.lt  
Vytautė Markeliūnienė
Linas Paulauskis
Rūta Skudienė
Rūta Stanevičiūtė